個人事業主としての経験はあるが、確定申告をしていない（無申告）や申告内容を間違えていた場合（給与所得で申告）についての対処法をお話しします。
まず、税務の申告は、さかのぼって５年間は、申告（修正申告含む）できます。
ですので、無申告の場合は、さかのぼって確定申告をする。
そして、間違えて給与所得で申告していた場合は、営業所得に修正申告する。
という方法があります。
（あまりお勧めはしませんが、どうしても許可を取りたいという方にはお話しています）
そうすることで、個人事業主として経営していたことを証明できます。
（証明書類としては、５年分（又は６年分）の確定申告書や所得証明書、工事請負契約書などが必要）
ただ、注意しないといけないのは、確定申告（修正申告含む）することで、税金（延滞金なども含む）が発生する場合がありますので、税理士さんに相談することをお勧めします。
納税は、国民の義務ですので、当たり前に毎年しっかりやっていきましょう！